As linhas de pesquisa do Programa estão distribuídas entre as duas áreas de concentração na qual atuam nossos docentes.

Biociências
Na área de Biociências são desenvolvidas pesquisas básicas visando a geração de conhecimento aplicável à melhoria da saúde humana. A área se utiliza de ferramentas de bioquímica, biologia molecular e biologia celular. As linhas de pesquisa do PPGBB ligadas à área de Biociências são:

Caracterização bioquímica, molecular, genética ou estrutural de agentes infecciosos e seus hospedeiros.
Nessa linha, nossas pesquisas visam elucidar mecanismos múltiplos através dos quais microrganismos e vírus patogênicos causam danos aos seus hospedeiros. É também objetivo dessa linha de pesquisa produzir conhecimento sobre características essenciais da fisiologia desses patógenos.
- BEATRIZ GOMES GUIMARAES
- CAMILA ZANLUCA
- CLAUDIA NUNES DUARTE DOS SANTOS
- JULIANO BORDIGNON
- LETUSA ALBRECHT
- LIA CAROLINA ALMEIDA SOARES DE MEDEIROS
- MARCEL IVAN RAMIREZ
- NILSON IVO TONIN ZANCHIN
- PRYSCILLA FANINI WOWK
- TARCIO TEODORO BRAGA
- TATIANA DE ARRUDA CAMPOS BRASIL DE SOUZA
- WANDER ROGERIO PAVANELLI

Regulação da expressão gênica de microrganismos e parasitas.
Nessa linha, os estudos desenvolvidos pelos docentes do Programa visam elucidar os mecanismos de regulação da expressão gênica de protozoários, fungos e bactérias causadores de doenças em humanos.
- LYSANGELA RONALTE ALVES
- MARCIO LOURENCO RODRIGUES
- SAMUEL GOLDENBERG

Caracterização molecular de células tronco
O potencial de aplicação de células tronco em modelos biológicos em geral e em agravos humanos é enorme. Nesse cenário, a linha de pesquisa “Caracterização molecular de células tronco” visa gerar conhecimentos sobre as propriedades mais essenciais de células tronco, bem como sobre sua aplicação em modelos de saúde humana.
- ALEJANDRO CORREA DOMINGUEZ
- ALESSANDRA MELO DE AGUIAR
- BRUNO DALLAGIOVANNA MUNIZ
- MARCO AUGUSTO STIMAMIGLIO
- PATRICIA SHIGUNOV
- ANA LUIZA PAMPLONA MOSIMANN
- ANDREA RODRIGUES AVILA
- FABIOLA BARBIERI HOLETZ
- LEONARDO FOTI
- LYRIS MARTINS FRANCO DE GODOY
- MARCOS ROBERTO LOURENZONI
- SHEILA CRISTINA NARDELLI
- STENIO PERDIGAO FRAGOSO
- TATIANA DE ARRUDA CAMPOS BRASIL DE SOUZA
Biotecnologia
A área de concentração de Biotecnologia trata de pesquisas voltadas para a geração de benefícios para a saúde da população brasileira. Nessa área de concentração, os docentes do Programa atuam em três linhas de pesquisa:

Bioinformática
A Bioinformática consiste de área multidisciplinar e essencial para várias subáreas das Ciências Biológicas. Além de gerar informação científica em alto rendimento, a área permite o processamento de grandes volumes de dados, ação indispensável para o desenho de ferramentas profiláticas, terapêuticas e diagnósticas em saúde humana.
- FABIO PASSETTI
- GUILHERME FERREIRA SILVEIRA
- HELISSON FAORO
- PAULO COSTA CARVALHO
- TIAGO GRAF

Biotecnologia de vacinas e testes diagnósticos
É clara a necessidade de ferramentas para prevenção e diagnóstico de uma série de agravos de importância inquestionável para a população brasileira. Sendo assim, o Programa desenvolve vários projetos visando melhorar o diagnóstico e a prevenção de doenças humanas.
- FABIANO BORGES FIGUEIREDO
- LUCAS BLANES
- MARCO AURELIO KRIEGER
- ALEXANDRE DIAS TAVARES COSTA

Genômica, proteômica e metaboloma
A área de estudos composicionais em sistemas biológicos vem passando por crescimento contínuo, dado o seu potencial de contribuir com o entendimento de uma série de mecanismos ligados à fisiopatologia de doenças humanas. O Programa vem desenvolvendo vários estudos sobre genômica, proteômica e metaboloma em doenças humanas, em pleno alinhamento com tendências científicas internacionais e em próxima ligação com a área de Bioinformática.
- FABRICIO KLERYNTON MARCHINI
- MATEUS NOBREGA AOKI
- DALILA LUCIOLA ZANETTE
- TATIANA DE ARRUDA CAMPOS BRASIL DE SOUZA